Análise de agrupamento de diferentes densidades de marcadores no mapeamento genético por varredura genômica

Revista Ceres

Marcelo Jangarelli²  Ricardo Frederico Euclydes¹  Cosme Damião Cruz¹  Paulo Roberto Cecon¹  Antonio Policarpo Souza Carneiro¹ 

[1] ,Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro

关键词: Análise de cluster;    herdabilidade;    seleção genômica;    simulação;    QTL;    Cluster analysis;    heritability;    genome selection;    simulation;    QTL;   

DOI  :  10.1590/S0034-737X2010000600001

来源: SciELO

【 摘 要 】

A simulação tem contribuído para o avanço da genômica nas diversas áreas do melhoramento genético. Foram simulados mapeamentos genéticos utilizando diferentes densidades de marcadores para estimar os valores fenotípicos na seleção assistida por marcadores (SAM), em características quantitativas com valores de herdabilidade de 0,10; 0,40; e 0,70. Procedeu-se a análise de agrupamento com os desempenhos fenotípicos, cuja finalidade foi obter estruturas de classificação entre as densidades visando à otimização na detecção de QTL. O sistema de simulação genética (Genesys) foi utilizado para três genomas (cada qual constituído de uma única característica cuja distinção estava no valor da herdabilidade) e para as populações base e inicial. Cada população inicial foi submetida à seleção assistida por marcadores por 20 gerações consecutivas, em que os genitores selecionados acasalavam-se seletivamente entre os melhores e os piores. O mapeamento empregando de média a alta densidade de marcadores assinalou eficiência nos progressos fenotípicos obtidos com a SAM. Menores quantidades de marcadores são requeridas para manter determinado poder de detecção de QTL à medida que se eleva a magnitude da herdabilidade. A análise de agrupamento indicou otimização e correspondência nos incrementos fenotípicos ao admitir as densidades de 4 e 6 cM; 4, 6, 8 e 10 cM; e 6 e 8 cM para as herdabilidades de 0,10; 0,40; e 0,70, respectivamente.

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