Rare genetic variants involved in multisystem inflammatory syndrome in children: a multicenter Brazilian cohort study

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Cellular and Infection Microbiology

Otavio Cabral-Marques¹  Desirée Rodrigues Plaça²  Igor Salerno Filgueiras³  Jaqueline Rodrigues Robaina⁴  Mariana Barros Genuíno de Oliveira⁴  Gustavo Rodrigues-Santos⁴  Arnaldo Prata-Barbosa⁵  Adriana Cesar Bonomo⁶  Wilson Savino⁶  Zilton Farias Meira de Vasconcelos⁷  Helisson Faoro⁸  Fabio Passetti⁸  Flávia Cristina de Paula Freitas⁸  Felipe Rezende Caino de Oliveira⁹  Ana Paula Novaes Bellinat^1,10  Raquel de Seixas Zeitel^1,11  Dennyson Leandro Mathias Fonseca^1,12  Flavia Amendola Anisio de Carvalho^1,13  Maria Celia Chaves Zuma^1,14  Roberta Soares Faccion^1,14  Bárbara Carvalho Santos Dos Reis^1,15  Margarida dos Santos Salú^1,16  Daniella Campelo Batalha Cox Moore^1,17 

[1] Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF), Universidade de São Paulo (USP), São Paulo, SP, Brazil;Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas (ICB), USP, São Paulo, SP, Brazil;Programa Interunidades de Pós-graduação em Bioinformática, Instituto de Matemática e Estatística (IME), USP, São Paulo, SP, Brazil;Network of Immunity in Infection, Malignancy, and Autoimmunity (NIIMA), Universal Scientific Education and Research Network (USERN), São Paulo, Brazil;Department of Medicine, Division of Molecular Medicine, University of São Paulo School of Medicine, São Paulo, SP, Brazil;Laboratory of Medical Investigation 29, University of São Paulo School of Medicine, São Paulo, Brazil;Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF), Universidade de São Paulo (USP), São Paulo, SP, Brazil;Programa de Pós-Graduação em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia), FCF, USP, São Paulo, SP, Brazil;Departamento de Imunologia, Instituto de Ciências Biomédicas (ICB), USP, São Paulo, SP, Brazil;Instituto D’Or de Pesquisa e Ensino (IDOR), Rio de Janeiro, Brazil;Instituto D’Or de Pesquisa e Ensino (IDOR), Rio de Janeiro, Brazil;Pediatric Intensive Care Unit, Instituto de Puericultura e Pediatria Martagão Gesteira (IPPMG), Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, Brazil;Laboratoírio de Pesquisas Sobre o Timo, Instituto Oswaldo Cruz (IOC), FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Instituto National de Ciencia e Tecnologia em Neuroimunomodulação (INCT/NIM), IOC, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Rede FAPERJ de Pesquisa em Neuroinflamação, IOC, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Rede INOVA-IOC em Neuroimunomodulação, IOC, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Laboratório de Alta Complexidade (LACIFF), Unidade de Pesquisa Clínica, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Laboratório de Regulação da Expressão Gênica, Instituto Carlos Chagas (ICC), FIOCRUZ, Curitiba, PR, Brazil;Pediatric Intensive Care Unit, Hospital Alvorada Moema, São Paulo, SP, Brazil;Pediatric Intensive Care Unit, Hospital Martagão Gesteira, Salvador, BA, Brazil;Pediatric Intensive Care Unit, Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE), Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ), Rio de Janeiro, Brazil;Programa Interunidades de Pós-graduação em Bioinformática, Instituto de Matemática e Estatística (IME), USP, São Paulo, SP, Brazil;Programa de Pós Graduação em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher, Instituto Nacional de Saúde da Mulher, da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira (IFF), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Departamento de Imunologia, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Programa de Pós Graduação em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher, Instituto Nacional de Saúde da Mulher, da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira (IFF), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Laboratório de Alta Complexidade (LACIFF), Unidade de Pesquisa Clínica, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Programa de Pós Graduação em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher, Instituto Nacional de Saúde da Mulher, da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira (IFF), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Laboratório de Alta Complexidade (LACIFF), Unidade de Pesquisa Clínica, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Departamento de Imunologia, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Programa de Pós Graduação em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher, Instituto Nacional de Saúde da Mulher, da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira (IFF), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Laboratório de Alta Complexidade (LACIFF), Unidade de Pesquisa Clínica, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Pediatric Intensive Care Unit, Hospital Martagão Gesteira, Salvador, BA, Brazil;Unidade de Pacientes Graves, Departamento de Pediatria, IFF, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;Faculdade de Medicina, Universidade Federal Fluminense, Niterói, Rio de Janeiro, RJ, Brazil;

关键词: multisystem inflammatory syndrome in children;    pediatric inflammatory multisystem syndrome;    coronavirus infection;    mucocutaneous lymph node syndrome;    Kawasaki disease;    whole exome sequencing;    whole exome sequencing;   

DOI  :  10.3389/fcimb.2023.1182257

 received in 2023-03-08, accepted in 2023-06-23,  发布年份 2023

来源: Frontiers

【 摘 要 】

IntroductionDespite the existing data on the Multisystem Inflammatory Syndrome in Children (MIS-C), the factors that determine these patients evolution remain elusive. Answers may lie, at least in part, in genetics. It is currently under investigation that MIS-C patients may have an underlying innate error of immunity (IEI), whether of monogenic, digenic, or even oligogenic origin.MethodsTo further investigate this hypothesis, 30 patients with MIS-C were submitted to whole exome sequencing. ResultsAnalyses of genes associated with MIS-C, MIS-A, severe covid-19, and Kawasaki disease identified twenty-nine patients with rare potentially damaging variants (50 variants were identified in 38 different genes), including those previously described in IFNA21 and IFIH1 genes, new variants in genes previously described in MIS-C patients (KMT2D, CFB, and PRF1), and variants in genes newly associated to MIS-C such as APOL1, TNFRSF13B, and G6PD. In addition, gene ontology enrichment pointed to the involvement of thirteen major pathways, including complement system, hematopoiesis, immune system development, and type II interferon signaling, that were not yet reported in MIS-C.DiscussionThese data strongly indicate that different gene families may favor MIS- C development. Larger cohort studies with healthy controls and other omics approaches, such as proteomics and RNAseq, will be precious to better understanding the disease dynamics.

【 授权许可】

Unknown   
Copyright © 2023 Reis, Soares Faccion, de Carvalho, Moore, Zuma, Plaça, Salerno Filgueiras, Leandro Mathias Fonseca, Cabral-Marques, Bonomo, Savino, Freitas, Faoro, Passetti, Robaina, de Oliveira, Novaes Bellinat, Zeitel, Salú, de Oliveira, Rodrigues-Santos, Prata-Barbosa and Vasconcelos