MOLEKULARNE TESTY DIAGNOSTYCZNE IDENTYFIKUJĄCE NOSICIELI MUTACJI GENÓW SLC3A1 I SLC7A9 POWODUJĄCYCH CYSTYNURIĘ U KOTA DOMOWEGO – ANALIZA IN SILICO

Folia Pomeranae Universitatis Technologiae Stetinensis seria Agricultura, Alimentaria, Piscaria et Zootechnica

article

Joanna KAŁUSKA¹  Beata GRZEGRZÓŁKA²  Joanna GRUSZCZYŃSKA² 

[1] Scientific Association of Experimental and Laboratory Animals, Warsaw University of Life Sciences – SGGW;Department of Animal Genetics and Conservation, Institute of Animal Sciences, Warsaw University of Life Sciences – SGGW

关键词: cystinuria;    urolithiasis;    SLC31A1;    SLC7A9;    mutations.;   

DOI  :  10.21005/AAPZ2023.66.2.4

来源: West Pomeranian University of Technology

【 摘 要 】

Cystynuria to dziedziczna choroba o podłożu genetycznym, związana z mutacjami w obrębie genów SLC3A1 i SLC7A9. Wyniki badań u kotów wskazują na niejednorodność tej choroby. Do tej pory odkryto 1 mutację genu SLC3A1 oraz 5 mutacji genu SLC7A9. Cystynuria jest chorobą nierzadko wykrywaną zbyt późno, gdy osobniki dorosłe mają już potomstwo. Dlatego tak ważne jest podejmowanie działań, które pozwolą na szybką i łatwą diagnozę choroby, jeszcze przed pojawieniem się objawów. Celem badań było zaprojektowanie prostych testów diagnostycznych umożliwiających identyfikację nosicieli zmutowanych alleli, które mogą powodować cystynurię u kota domowego. Prze- prowadzono analizę bioinformatyczną powiązań białek SLC3A1 i SLC7A9 z innymi białkami i próbowano ocenić zmiany strukturalne i funkcjonalne zachodzące na skutek mutacji. W analizach bioin- formatycznych wykorzystano następujące programy i bazy danych: Ensembl, NCBI, Primer-BLAST, NEBcutter, STRING, SWISS-MODEL, Variant Effect Predictor (VEP). Proponowane startery i enzymy do testów PCR-RFLP i AS-PCR umożliwiają identyfikację osobników będących nosicielami mutacji. Interakcje białek SLC3A1 i SLC7A9 z innymi białkami sugerują możliwe powiązania cystynurii z rozwojem innych chorób. Może to pośrednio tłumaczyć niejednorodne, złożone objawy towarzyszące cystynurii. Mutacja w egzonie 5 genu SLC7A9 (p.Asp236Asn) powoduje zmianę w przewidywanej konformacji przestrzennej białka. Z wykorzystaniem programu bioinformatycznego VEP oceniono wpływ wszystkich mutacji na funkcjonalność białka jako szkodliwy. Uważa się za konieczne, aby hodowcy w pierwszej kolejności przeprowadzali test molekularny wykrywający mutację genu SLC7A9 egzonu 7 w pozycji c.881, ponieważ wydaje się, że jest to najbardziej rozpowszechniona mutacja w populacji kota domowego.

【 授权许可】

Unknown