Relación filogenética de roya del café en la selva central dePerú

Acta Agronomica

article

Delia Palmira Gamarra Gamarra¹  Gilberto Torres Suarez¹  Charo Milagros Villar Quiñonez¹  Alistair R. McTaggart²  Emerson Clovis Carrasco Lozano¹ 

[1] Universidad Nacional del Centro del Perú;University of Queensland

关键词: Coffea arabica;    DNA barcode;    Hemileia vastatrix;    Peru;    phylogeny(en)Coffea arabica;    DNA barcode;    Hemileia vastatrix;    Perú;    filogenia(es);   

DOI  :  10.15446/acag.v70n2.88945

学科分类：农业科学（综合）

来源: Universidad Nacional de Colombia * Facultad de Ciencias Agropecuarias Palmira

【 摘 要 】

La roya del café es la principal enfermedad que causa pérdidas significativas en Coffea arabica. En Perú esta enfermedad causó epidemias entre 2008 y 2013 con pérdidas de 35 % de la producción. El objetivo fue identificar H. vastatrix mediante un enfoque morfológico y molecular basado en un concepto de especie filogenética. Se recogieron muestras de hojas de café con síntomas de lesiones cloróticas con presencia de uredosporas amarillas en diferentes estados de severidad de diferentes cultivares en 11 localidades de los departamentos de Pasco y Junín durante el período 2017-2018. El ADN se purificó según lo propuesto por Cristancho y sus colaboradores. Se amplificó la subunidad mayor del ADN ribosomal con primers universales, LR0R y LR5, y fue secuenciada por Macrogen y depositadas en GenBank. Para el análisis filogenético se incluyeron secuencias de los géneros Achrotelium, Blastospora, Cystopsora, Hemileia y Mikronegeria. Los resultados mostraron que la roya se distribuyó en regiones cafetaleras de Pasco: Villa Rica (Catimor, Caturra y Gran Colombia), Oxapampa (Caturra Amarilla) y Junín: San Luis de Shuaro (Catimor), Chanchamayo (Catimor), San Ramón (Catimor), Vitoc (Caturra), Pichanaki (Caturra), Río Negro (Caturra), Pangoa (Caturra Amarilla, Gran Colombia, Limani). Asimismo, se agrupó en un solo clado con H. vastatrix aislados de México y Australia, lo cual sugiere que provienen de un ancestro común. Este es el primer informe confirmado que utiliza un código de barras molecular de H. vastatrix en la selva central del Perú.

【 授权许可】

CC BY-NC-SA