Utilização de marcadores moleculares RAPD e EST's SSR para estudo da variabilidade genética em cana-de-açúcar¹ Use of molecular markers RAPD, and ESTs SSR to study genetic variability in sugarcane

Revista Ciência Agronômica

关键词: Cana-de-açúcar;    Melhoramento Vegetal;    Moléculas-modelos;    Sugarcane;    Plant Breeding;    Molecular-models;   

DOI  :  10.1590/S1806-66902013000100018

来源: DOAJ

【 摘 要 】

Marcadores moleculares dos tipos RAPD e EST's SSR foram utilizados como ferramentas para avaliar a variabilidade bem como estimar a divergência genética entre variedades comerciais e clones de cana-de-açúcar oriundos via autofecundação. Vinte e três genótipos foram utilizados neste estudo oriundos do Programa de Melhoramento Genético da Cana-de-açúcar da Rede Interuniversitária para o Desenvolvimento do Setor Sucroalcooleiro (PMGCA/RIDESA). A extração do DNA genômico seguiu a metodologia CTAB com modificações para cana-de-açúcar. Foram utilizados 11 oligonucleotídeos RAPD da operon Technologies e 7 EST's SRR obtidos através de uma extensa revisão de literatura. As análises da divergência genética foram realizadas com o auxílio do Programa GENES. Os marcadores RAPD detectaram um alto grau de polimorfismo genético, produzindo 61 bandas, das quais 58 foram polimórficas. Os marcadores EST's SSR amplificaram 38 alelos, sendo 34 polimórficos. Havendo a formação de três grupos, com a população estudada. A maior parte da variação genética foi mantida dentro das progênies, evidenciando a ocorrência de um alto grau de variabilidade genética entre os genótipos de cada progênie para fins de melhoramento. Através da divergência genética estimada foi possível identificar parentais divergentes para trabalhos de hibridação, visando a obtenção de clones superiores com caracteres de interesse à agroindústria canavieira. Os marcadores molecuares RAPD e EST's SSR foram igualmente eficientes para estimar a variabilidade genética nos genótipos testados e elaborar os cruzamentos a serem realizados nos programas de melhoramento.
Molecular markers of the type RAPD and ESTs SSR were used as tools to evaluate the variability, and estimate the genetic divergence between commercial varieties and sugarcane clones from self-pollination. Twenty-three genotypes from the Program for the Genetic Improvement of Sugarcane of the Interuniversity Network for the Development of the Sugar-alcohol Sector (PMGCA/RIDESA), were used in this study. The extraction of genomic DNA followed CTAB methodology, with modifications being made for sugarcane. Eleven RAPD oligonucleotides, obtained from Operon Technologies, and 7 ESTs SRR, found after an extensive review of the literature, were used. Analyses of genetic diversity were carried out using the GENES software. The RAPD markers detected a high degree of genetic polymorphism, producing 61 bands, of which 58 were polymorphic. The ESTs SSR markers amplified 38 alleles, 34 being polymorphic. Three groups being formed with the population studied. Most of the genetic variation was maintained among progeny, indicating the occurrence, for purposes of breeding, of a high degree of genetic variability among the genotypes of each progeny. Through estimated genetic divergence, it was possible to identify divergent parent plants, which could be used in hybridization in order to obtain superior clones with characteristics of interest to the sugarcane industry. The molecular markers RAPD and ESTs SSR were equally efficient in estimating the genetic variability in the genotypes tested, and in preparing crossbreeds to be used in breeding programs.

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