APORTES Y DIFICULTADES DE LA METAGENÓMICA DE SUELOS Y SU IMPACTO EN LA AGRICULTURA.

Acta Biológica Colombiana

Daniel Vázquez¹  María Rosete Enríquez¹  América Paulina Rivera-Urbalejo²  Catherine Cesa-Luna²  Yolanda Elizabeth Morales-García²  Jesús Muñoz Rojas²  Veronica Quintero Hernández³  José Luis Fernández Vázquez⁴ 

[1] Benemérita Universidad Autónoma de Puebla.;Benemérita Universidad Autónoma de Puebla;CONACYT-INSTITUTO DE CIENCIAS, BENEMÉRITA UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE PUEBLA;Universidad Nacional Autónoma de México;

关键词: Metagenómica;    Suelo;    Agricultura;    Inoculantes;    Bacterias Promotoras del crecimiento PGPR´s.;   

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来源: DOAJ

【 摘 要 】

Los microorganismos son de gran interés porque colonizan todo tipo de ambiente, sin embargo, uno de los problemas al que nos enfrentamos para conocer su diversidad biológica es que no todos los microorganismos son cultivables. El desarrollo de nuevas tecnologías como la generación de vectores de clonación aunado al desarrollo de técnicas de secuenciación de alto rendimiento ha favorecido el surgimiento de una nueva herramienta llamada metagenómica, la cual nos permite estudiar genomas de comunidades enteras de microorganismos. Debido a que ningún ambiente es idéntico a otro, es importante mencionar que dependiendo del tipo de muestra a analizar será el tipo de reto al cual nos enfrentaremos al trabajar con metagenómica, en el caso específico del suelo existen diversas variantes como la contaminación del suelo con metales pesados o diversos compuestos químicos que podrían limitar los estudios. Sin embargo, pese a las limitaciones que el mismo ambiente presenta, la metagenómica ha permitido tanto el descubrimiento de nuevos genes como la caracterización de las comunidades microbianas que influyen positivamente en el desarrollo de plantas, lo cual en un futuro podría generar un gran impacto en la agricultura. En este artículo se realizó una revisión de diversas investigaciones que han empleado metagenómica, reportadas en las bases de datos de PudMed y Google Schoolar, con el objetivo de examinar los beneficios y limitaciones de las diversas metodologías empleadas en el tratamiento del ADN metagenómico de suelo y el impacto de la metagenómica en la agricultura.

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