Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites

Pesquisa Agropecuária Brasileira

Carlos Antonio Fernandes Santos²  Valter Rodrigues Oliveira¹  Marciene Amorim Rodrigues²  Hugo Leonardo Coelho Ribeiro² 

[1] ,Embrapa SemiáridoPetrolina PE

关键词: Allium cepa;    dendrograma;    similaridade;    SSR;    Allium cepa;    dendrogram;    similarity;    SSR;   

DOI  :  10.1590/S0100-204X2010000100007

来源: SciELO

【 摘 要 】

O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coeficiente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos SSR foram suficientes para distinguir as 44 cultivares de cebola. O maior número de alelos em comum foi observado entre as cultivares Yellow Granex e Henry's Special PRR e o menor, entre as cultivares Baia Periforme Super Precoce e Excel. Os sete grupos principais de cultivares identificados no dendrograma apresentaram concordância com a genealogia conhecida e o tipo agronômico das cultivares avaliadas. Os locos SSR selecionados são adequados para melhoramento e proteção de cultivares da espécie.

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