Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C

Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical

Patrícia Martinez Levada²  Camila Fernanda Verdichio De Moraes¹  Silvia Maria Corvino²  Rejane Maria Tommasini Grotto²  Giovanni Faria Silva¹  Maria Inês De Moura Campos Pardini² 

[1] ,Universidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina de Botucatu Faculdade de Medicina de BotucatuBotucatu SP

关键词: Vírus da hepatite C;    Genotipagem;    Hibridização reversa;    Sequenciamento direto;    Hepatitis C virus;    Genotyping;    Reverse hybridization;    Direct sequencing;   

DOI  :  10.1590/S0037-86822010000200006

来源: SciELO

【 摘 要 】

INTRODUÇÃO: Os métodos de genotipagem do vírus da hepatite C têm sido muito discutidos. O objetivo deste trabalho foi comparar as metodologias de hibridização reversa e sequenciamento direto para a genotipagem do vírus da hepatite C. MÉTODOS: Noventa e uma amostras de plasma de pacientes assistidos na Faculdade de Medicina de Botucatu da Universidade Estadual Paulista foram utilizadas. A genotipagem por hibridização reversa foi realizada utilizando o kit comercial INNO-LiPA® v.1.0. O sequenciamento direto foi efetuado em sequenciador automático utilizando protocolos in house. RESULTADOS: A genotipagem por sequenciamento direto mostrou-se eficiente na resolução dos resultados inconclusivos pelo kit comercial. O kit mostrou resultados errôneos em relação à subtipagem viral. Além disso, a genotipagem por sequenciamento direto revelou um erro do kit com relação à determinação genotípica questionando a eficiência do método também para a identificação do genótipo viral. CONCLUSÕES: A genotipagem realizada por meio de sequenciamento direto permite uma maior acurácia na classificação viral quando comparada à hibridização reversa.

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